南京大学昆山创新研究院是由昆山市政府和南京大学共建共管，经昆山市编制委员会办公室批准设立的独立事业法人单位。研究院依托于南京大学的人才和技术优势，紧密结合昆山的产业特色和发展需求，以昆山的新材料、新能源等产业的关键、共性技术需求为主导，构建政产学研紧密结合的科技创新创业平台，开展技术应用研发和成果转化工作，培育和发展创新型科技企业，为昆山的跨越发展提供科技支撑和智力支持。目前，南京大学昆山创新研究院构筑了“三站”、“一院”、“两基地”人才高地格局。首个研发机构-南京大学昆山太阳能高效利用技术工程中心已入驻研究院，工程中心的部分研究成果-燃料电池和离网式风光互补电源成功转化到昆山桑莱特新能源科技有限公司，进行批量生产与销售。研究院正在积极遴选新材料与新能源、信息与光电技术、医疗及健康、生态与环境保护等重点领域的研发机构入驻研究院。研究院将发挥高校与地方政府的最大协同创新互动效应，着力推动企业技术创新、产业技术创新和社会发展创新，努力为建设创新型国家作出积极贡献。